幽门螺杆菌（Hp）感染与胃食管反流病（GERD）的关系至今尚未明确。有证据表明，长期应用质子泵抑制剂（PPI）治疗GERD时，Hp感染能够加重胃萎缩的进展。虽然如此，在有反流症状的GERD病人中，根除Hp对胃食管反流症状的疗效并不明确。欧洲Hp研究组建议对GERD病人的Hp感染进行根除治疗，但是同时也指出，根除治疗并没有确切的科学根据。
香港威尔士医院2004年报告，从经过内镜和症状评价每周有反流症状的236例病人中筛选有Hp感染和长期抑酸治疗的104例病人进行研究。研究者将104例病人随机分为奥美拉唑三联治疗组（HpE组 53例）和奥美拉唑加安慰剂治疗组（Hp+组 51例）进行为期1周的治疗。继之针对食管炎和缓解反流症状，服用奥美拉唑每天20mg ，治疗8周。然后应用奥美拉唑每天10mg，维持治疗12个月。以治疗初期2个月，反流症状和食管炎不能完全缓解和在维持期12个月内反流症状、食管炎复发作为治疗失败的终点事件。应用Cox 比例风险模型预测疗效失败的可能性。结果显示，HpE组和Hp+组Hp根除率分别为98%、3.9%；HpE组和Hp+组初始治疗失效分别为28%、16%；HpE组和Hp+组12个月治疗失败的可能性分别为43%、21%。提示根除Hp可能导致更多的胃食管反流病反弹。
目前GERD与Hp感染间关系的争议较多，没有达到广泛共识。笔者认为，对于GERD病人Hp感染的治疗，应密切结合患者的实际情况，从整体的观点考虑是否进行根除治疗。对于合并消化性溃疡或多灶萎缩性胃炎有Hp根除指征或有胃癌家族史、胃癌高发区的GERD病人，应该予以根除治疗
